El Instituto “ Cristino Tróchez Barahona” fue creado mediante decreto No. 174 – 94 del Poder Legislativo en 1994, debido a la demanda educativa y la necesidad de un centro de educación media para desarrollar el municipio de Atima. Inicia sus labores el 15 de febrero de 1995 en la modalidad de Ciclo Común de Cultura General Con una matrícula de 82 alumnos.

En el año 1997 se logro la construcción del edificio en el predio ubicado en el barrio de Jesús del municipio de Atima por gestiones de un patronato quienes adquirieron el terreno y la construcción del edificio por gestiones del gobierno Central mediante el diputado Abog. Héctor Ramon Tróchez durante el gobierno del Dr. Carlos Roberto Reina , el nombre del instituto es en honor al padre del abogado cuyo nombre es «Cristino Tróchez Barahona» 

En el año 1998 debido al crecimiento poblacional se crea la modalidad de Educación Comercial, Además en el año 2000 se cambia la modalidad de Ciclo Común  a Polivalente;

del 2004 al 2008 funciono la jornada nocturna pero por no haber suficiente demanda se dejo de brindar

En el 2008 se implementa la carrera de Bachillerato en Ciencias y Letras, en el año 2012  se implemento el técnico en computación y por producto de la reforma educativa la modalidad de bachillerato técnico profesional. Y sucesivamente, se abrieron nuevas carreras.